人體內的支原體感染主要表現為支原體肺炎，臨床上一般使用大環內酯類藥物進行治療，如阿奇霉素等。如果出現咳嗽比較劇烈的癥狀還需適當使用鎮咳藥，需等基本癥狀消失之后才可停藥。

支原體感染一般會導致機體呼吸系統和泌尿系統出現感染，患者可使用大環內酯類或者喹諾酮類抗菌藥物進行治療。本病具有自限性，部分患者不用藥也可痊愈，用藥可以縮短病程。