肺炎支原體陰性，一般表示目前沒有感染支原體，做檢測結果是陰性的，其次，還與可能是檢查過程中，標本存在誤差導致的。另外，還有一種情況，是感人看肺炎支原體，但是因為病情很輕，或是剛開始發病，這時檢查也是查不出的。

肺炎支原體陰性可能沒有感染過肺炎支原體，但有時即便其抗體陰性，也不能除外有無肺炎支原體的感染。肺炎支原體抗體有IgM抗體和IgG抗體。如果IgM抗體陰性，而IgG抗體陽性，通常提示患者既往感染過肺炎支原體，此時不處于急性感染期。如果IgM抗體陽性，IgG抗體陰性，多提示患者處于肺炎支原體感染的急性期，需要予以相應的抗感染治療。