非典的后遺癥，一是會引起肺部感染，二是容易引起肝功能衰竭或腎功能衰竭，多需要長期做透析治療。另外，非典后遺癥還會有股骨頭壞死，多是正在治療時應用激素引起的，可以長期服藥或做關節置換術等治療。

非典后遺癥主要是由于治療和預防非典所遺留下的后遺癥，主要是由于在使用激素時所留下，最常見的后遺癥就是股骨頭壞死。其次，還會出現彌漫性肺間質纖維化、精神障礙等多種后遺癥，在治療上可以使用人工髖關節置換術進行治療，如果出現了彌漫性肺間質纖維化，可以使用少量的激素來維持，也可以適當的給予氧氣進行治療。