骨髓移植對捐獻者的危害不是非常的大，可能會出現全身乏力、煩躁不安以及肝脾腫大的癥狀，但是不正規的操作可能會導致骨骼疼痛、食欲下降以及身體消瘦，嚴重者會出現死亡。

骨髓移植對捐贈者沒有明顯的傷害。過去，骨髓移植可能會給捐贈者帶來一些痛苦。因為過去骨髓捐獻是在手術室進行的，捐獻者需要麻醉，然后在病者的髂骨上進行骨髓穿刺，并且進行多次骨髓穿刺以提取足夠的骨髓液，這會給病者的身體造成一些疼痛。然而，隨著科學技術的發展，骨髓捐獻的方法得到了明顯的改進。骨髓是一種再生能力強的組織，捐獻后大約一周內可以完全恢復。