肛門痛的原因有很多，大部分跟肛周炎癥和腸炎有關。有腸炎疾病的患者，因為排便次數較多，肛門經常受到糞便的污染，所以導致疼痛。如果患者有飲食辛辣的習慣，肛門還會有灼燒感的疼痛，則可能是肛周膿腫。

肛門疼痛，原因復雜，多見于以下幾點：第1點，直腸惡性腫瘤，常侵犯到周圍組織，引起肛門疼痛。同時患者由于排便不盡，大便梗阻，容易出現腸梗阻的表現，常難以忍受，來醫院就診。第2點，內痔脫出明顯時，出現嵌頓，多形成環狀痔、梅花痔，肛門劇痛，可見團塊脫出，呈梅花狀。常需要進行回納治療。第3點，血栓性外痔，肛門周圍可出現劇痛，可觸及血栓存在。