當體內感染病毒后立即通過血清學檢查，檢測結果通常為陰性，而在感染過程中，病毒會不斷刺激抗體，出現病毒翻倍侵襲的現象，直至再次檢測結果顯示為陽性，這段時間便為窗口期。

窗口期一般指的是從感染某一病毒到能檢測出相應抗體的這一段時間，窗口期內檢測不到病毒的抗體，因此臨床無法確診，但血液中往往帶有一定量的病毒，實際上已經發生了感染。窗口期內具有一定的傳染性，例如如果和艾滋病窗口期的患者的血液有交叉接觸，可能會感染上艾滋病。在窗口期內，患者可能會出現一些非特異性癥狀和體征，例如艾滋病窗口期內，患者可能會出現低熱、淋巴結腫大、納差、腹瀉、關節疼痛等。如果懷疑在某一種疾病的窗口期，需要做的是定期檢測，可以連續定期檢測2-3次，一直到最大潛伏期，如果仍為陰性，可以排除。