寶寶感冒咳嗽時是可以吃益生菌的，益生菌可以調節胃腸道的菌群，促進消化，但是對于呼吸道感染沒有治療作用。建議在口服益生菌以及服用感冒藥物的時候，要間隔一段時間，一般在兩個小時左右。

感冒咳嗽屬于呼吸道感染，益生菌對呼吸道感染沒有直接的保護作用，但是有一些情況，如呼吸道感染，查血常規，發現它屬于細菌感染，這時能需要口服抗生素來治療。抗生素在抗細菌的時候沒有選擇性，可能將腸道里的正常細菌和異常細菌全部都殺死，這種情況下，可以補充一些益生菌。但是補充益生菌需要特別要注意，口服益生菌的時候一定要在服用抗生素至少相隔兩個小時，或者抗生素控制發燒好了以后，再吃益生菌。