黃連的功效有清熱燥濕、瀉火解毒、養胃護胃、殺菌消炎等，還可以有效的緩解患者牙疼、反酸、嘔吐、腹瀉、口瘡等癥狀。臨床上主要適用于胃痛、胃潰瘍、胃炎、或是濕疹等疾病的治療。

黃蓮屬于一個苦寒類的藥物，它歸心、脾、胃、肝膽、大腸經，所以它治療的疾病也比較多。它的功效是一個清熱燥濕、瀉火解毒的作用。它主要常用于像一些痢疾，還有一些胃部不適的癥狀，包括胃痛，就是由胃熱引起的胃部的疾病，還有包括像腸道由濕熱引起的腹瀉、痢疾，這是一類消化道疾病；第二個對于一些急性膽囊炎、急性肝炎引起的黃疸可以用黃蓮；第三個就是由于高熱神昏、心火亢盛、心煩不寐導致的一些疾病，這方面往往，我們就和一些傳染病，或者是一些重度感染的疾病，導致了神經系統或者是神志精神的改變，或者是失眠，黃蓮我們常用；第四就是由于感染導致的一些血熱、吐衄，比如說由于感染導致的鼻衄、吐血或者是由于眼睛紅、牙疼等等這一類的癥狀；它還有一個止咳、消咳的作用。我們外用可以治療這種癰腫或者是癤腫之類的，這種皮膚的感染類的疾病，還有包括濕瘡、外耳道流膿等等都可以應用黃蓮，因此黃蓮它應用非常廣泛，從各個臟腑包括心、脾、胃、肝膽、大腸類的凡是有濕熱的，有熱毒的這種癥狀，這種疾病都可以用黃蓮。現代醫學藥理研究認為，它具有抗菌作用，有抗病毒作用，抗癌彌漫作用，抗炎、抗腹瀉作用，有解熱、降血糖、降血脂、抗氧化作用，黃蓮它的作用也是非常廣泛的。