奧硝唑氯化鈉注射液可治療多種厭氧菌感染引起的腹部感染、盆腔感染、口腔感染、皮膚及軟組織感染和腦部感染，也可用于治療消化系統阿米巴蟲病。奧硝唑氯化鈉注射液對肝臟有損害，不宜長期使用。

奧硝唑氯化鈉注射液是臨床上用于厭氧菌感染的抗生素，對于需氧菌和兼性需氧菌治療無效，臨床上也可以用于陰道毛滴蟲、阿米巴滋養體和破傷風感染的治療。臨床上可以用奧硝唑氯化鈉注射液治療口腔、腹腔、泌尿生殖以及骨關節系統的感染，吸收后在體內分布廣泛，副作用小，不良反應少。但是用藥期間和用藥停止3天內，盡量不要飲用含酒精的飲料，容易引起藥物不良反應，有害無益。