由于每個人的體質不同、心理狀況不同，所以生理脫毒階段的時間也是因人而異的。一般來說，生理脫毒大概需要1-2周，在戒毒的期間，要多喝水，促進自身的新陳代謝。另外，要多吃富含維生素的食物，以提高機體免疫力。

脫毒治療是整個戒毒治療的第一步。急性反應癥狀是七到十天，睡眠障礙半個月，情緒反應二三個月。一般來說，阿片類藥物依賴首先要進行脫毒治療，即通過治療減輕由于突然停藥導致的軀體戒斷癥狀。由于吸毒人員的特殊性，阿片類藥物依賴的脫毒治療應在管理嚴格的封閉環境中進行。苯丙胺類藥物依賴的脫毒治療包括軀體戒斷癥狀、急、慢性中毒及精神障礙等方面的診治。此外，很多吸毒人員因長期吸毒，身體或精神上可能患有各種疾病。在進行戒毒的初期，對這些疾病的診斷與治療是必需的。