肺結核耐藥的表現依舊會出現咳嗽、咯血、精神萎靡、食欲不佳、盜汗等癥狀。最為明顯的表現在于使用抗結核藥物后，患者的不適癥狀不但沒消失，反而出現越來越嚴重的趨勢。

肺結核耐藥后，雖然仍在治療，但癥狀不但不會變好，甚至比之前更重，例如咳嗽、晚上出汗、咳出血絲、沒有力氣、做事沒有干勁、不想吃東西等。胸片檢查肺中的陰影較服藥前沒有變小，感染也沒有得到有效的控制，甚至開始向別處轉移，如骨、大腸等地方。如果出現了這種狀況，最好取痰液做培養，并做藥敏實驗，選擇合適的抗生素進行治療，免受結核的困擾。