如果萎縮較輕，或者是可治的肌肉萎縮疾病，治好致病因后，積極進行術后治療以及通過科學的康復訓練可以恢復，如果病情嚴重，導致肌肉神經損傷嚴重，通過康復訓練也無改善則恢復的幾率很小。

肌肉萎縮能否恢復與病因有關。部分輕微的肌肉萎縮，還能通過長期的康復訓練獲得恢復。但是如果支配該區域的神經出現完全損傷，則肌肉萎縮不可逆轉，同時還會引起活動受限，并帶來其他嚴重的并發癥。因此判斷肌肉萎縮是否能夠恢復的關鍵因素，是進行必要的肌電圖檢查，以判斷神經損傷的嚴重程度。嚴重的神經損傷往往不能自行恢復，需要進行手術治療，然后配合康復訓練才能獲得恢復。