頸椎后腦勺疼多由頸動脈型頸椎病，引起頸動脈痙攣所致。也考慮為頸椎骨質再生，出現的無菌性炎癥，所引起頸椎后腦勺部位疼痛。引起頸部后腦勺疼痛的病因較多，建議就醫確診。

頸椎癥的后腦部疼痛是由椎間盤或局部的關節刺激頸后神經引起的。此外頸椎病引起的局部肌肉痙攣，勞損，也可表現為頸部后位置疼痛，部分患者合并等癥狀可能有頭暈，頸部發酸。頸椎病后頭痛患者常有較長的頭部彎曲或頸部勞損史。重癥患者甚至無法治愈，只能通過物理治療或藥物輔助治療來緩解疼痛。