寶寶結膜炎一般伴有眼睛充血發紅、分泌物增多、不自主流淚、眼部瘙癢、畏光等癥狀。部分患兒會出現眼瞼水腫等癥狀，若出現以上癥狀，建議及時帶寶寶到醫院眼科進行檢查。

兒童結膜炎的癥狀與成人中的癥狀相似。通常，嬰兒的眼睛出現紅血絲，分泌物變多，會經常揉眼，甚至一些兒童結膜炎也會出現明顯的眼皮水腫。兒童結膜炎是主要的局部病變，即眼睛結膜炎癥。如果結膜炎涉及角膜并引起角膜病，則其可導致兒童視敏度在不同程度上下降，甚至導致急性結膜炎，例如淋球菌結膜炎，這將嚴重影響視力，甚至導致失明。