甲狀腺過氧化物酶抗體過高的時候，主要考慮為橋本氏甲狀腺炎，對于這種情況如果沒有明顯的不適癥狀，通常不用治療定期檢查即可。另外，病情較重的時候則要運用促甲狀腺激素類的藥物進行治療。

甲狀腺過氧化物酶抗體高可能與橋本甲狀腺炎、甲狀腺功能亢進、原發性甲狀腺功能低下等甲狀腺疾病有關，也可能與結締組織疾病有關。需要結合抗甲狀腺球蛋白抗體檢查來綜合判斷疾病。