扁桃體發炎腫痛的患者可以應用氯己定含漱液漱口，能夠起到消炎止痛的作用。若疼痛癥狀較為嚴重，并且伴有發熱癥狀，患者可以服用解熱鎮痛藥物進行治療，比如對乙酰氨基酚、布洛芬等。其次，對于病毒感染引起的扁桃體炎，一般不需要應用抗病毒藥物進行治療；由細菌感染引起的扁桃體炎，應給予抗生素進行治療，比如阿莫西林、頭孢克肟等。對于反復發作的扁桃體炎，可以進行扁桃體切除術。