膽總管結石的主要癥狀取決于有無感染及梗阻，平時可無癥狀，但當結石梗阻膽管并繼發感染時，其典型的臨床表現為Charcot三聯征即腹痛、寒戰、高熱和黃疸。

腹痛主要表現為劍突下和右上腹疼痛，多為絞痛呈陣發性發作，或為持續性疼痛陣發性加重，可向右肩背部放射，常伴有惡心嘔吐，寒戰、高熱。

膽管梗阻繼發感染后膽管內壓升高，感染循膽管擴散，細菌及毒素經毛細膽管入肝竇及肝靜脈，再進入體循環而引起全身性感染，大部分病人可出現寒戰、高熱，體溫高者可達39-40度。

膽管梗阻后即可出現黃疸，其輕重程度發生和持續時間取決于膽管梗阻的程度、是否并發感染，有無膽囊等因素，如梗阻為部分或間歇性黃疸程度較輕，且呈波動性。

完全性梗阻時，特別是合并感染時，則黃疸明顯且呈進行性加深。