可通過疼痛時間、部位、性質等區別肝區疼痛與膽囊痛。

肝臟本身是不疼痛的，因為肝臟內沒有神經，所以肝臟早期至中期病變機體可能沒有任何感覺。肝區一旦感覺疼痛，大多為肝臟腫大引起肝臟包膜的張力過大引起的疼痛，如肝炎及肝炎恢復期、脂肪肝、酒精肝、肝臟巨大腫瘤等。

膽囊區的疼痛多與飲食相關。如攝入油炸油膩，辛辣刺激的食物后會出現膽囊區疼痛，伴肩背部放射痛。由于膽囊位于肝臟的下部，解剖位置臨近，伴有膽囊疾病時常誤認為肝區疼痛或肝區不適。這也是膽囊疾病常被誤解為肝病的原因。膽囊炎常常表現為厭油膩、惡心嘔吐，主要是由于膽汁釋放不足引起的。行肝膽脾腎彩超可以鑒別診斷。

此外，區別肝區疼還是膽囊疼，可以嘗試按住疼痛部位，然后進行深吸氣。如果因為疼痛不能深吸氣，那么極有可能是膽囊炎。而一般肝臟痛多是脹痛、肝功可以輔助診斷。值得注意的是，由于肝膽疾病多因飲食無規律和不良的生活習慣引起，因此平時注意日常生活習慣。