小腦血栓的后遺癥主要包括頭暈、平衡障礙、共濟障礙，也包括爆發性的語言。

后遺癥是指患者發病后一年仍留有癥狀和體征，一般情況下進入后遺癥期治療效果較差。

多數患者的治療主要是給予康復鍛煉，防止肌肉萎縮和肌肉攣縮，小腦血栓一般情況下患者可以出現頭暈、惡心、嘔吐、平衡障礙和共濟障礙，有些患者也可出現爆發強的語言。

該病治療主要是超早期溶栓治療，超過溶栓治療時間窗，可給阿司匹林抗血小板聚集治療，同時給神經保護以及改善血循環治療。

如果患者的血壓過偏低時也應給擴容治療，臨床上常用的擴容治療的藥物主要包括706代血漿、丁苯酞，以改善神經功能缺損的癥狀和體征。