寶寶小陰莖可能是正常的生理現象，也可能和原發性小陰莖、促性腺激素分泌異常等病理原因有關。

一、生理原因

寶寶年齡很小，內分泌功能還沒有發育成熟，第二性征也還沒有開始發育，所以陰莖較小是正常的現象。

二、病理原因

1、原發性小陰莖

這類患兒下丘腦-垂體-性腺軸的功能正常，可能和一過性睪酮分泌減少、雄激素受體異常等原因有關，但有部分患兒到青春期后陰莖可能會再次增長，達到正常水平。

2、促性腺激素分泌異常

促性腺激素分泌減少或分泌過多，都會影響睪酮的分泌功能，進而影響陰莖正常發育，出現小陰莖現象。