肺膿腫可分為原發性肺膿腫、繼發性肺膿腫以及血源性肺膿腫，不同的肺膿腫病原體不同。

1.原發性肺膿腫

原發性肺膿腫的主要病原體為鏈球菌、厭氧菌，病原菌經口、鼻、咽腔吸入引起感染，常形成右肺單發膿腔。

2.繼發性肺膿腫

繼發性肺膿腫常由細菌性肺炎、空洞型肺結核或阿米巴肝膿腫等引起，以肺炎鏈球菌、結核分枝桿菌或阿米巴蟲病原體等感染為主。

3.血源性肺膿腫

血源性肺膿腫多由金黃色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌等病原體感染引起，膿腔較小，多分布在兩肺外野。