新生兒肚子脹氣時可以吃益生菌，但需在醫生指導下使用。

益生菌有利于改善腸道菌群失調的情況，幫助恢復正常的消化吸收功能，從而緩解新生兒肚子脹氣的癥狀。常見的益生菌種類有雙歧桿菌、乳酸桿菌等，這些益生菌藥物可以促進腸道蠕動，調節腸道菌群平衡，保持腸道健康，促進新生兒的營養吸收。

但需要注意的是，吃益生菌主要適用于腸道菌群失調所引起的肚子脹氣。如果脹氣是由腸梗阻、飲食不合理等其他原因引起的，單純通過吃益生菌可能無法起到很好的治療效果，可能需要配合醫生接受手術治療或調整飲食。