纖維肌痛綜合征的確切病因尚不清楚，一般情況下和中樞神經系統敏化、神經遞質失衡、免疫系統異常等原因有關。

1.中樞神經系統敏化

中樞神經系統的敏化被認為是纖維肌痛綜合征的一個重要發病機制。這意味著中樞神經系統對疼痛信號的處理發生了改變，使得疼痛感知增強。

2.神經遞質失衡

某些神經遞質，如血清素和去甲腎上腺素，在纖維肌痛綜合征中可能失衡。這些神經遞質的異常可能影響疼痛感知和情緒調節。

3.免疫系統異常

免疫系統的異常反應可能在纖維肌痛綜合征的發病中起作用。自身免疫反應或免疫系統的過度活躍可能導致炎癥和疼痛的產生。