三叉神經痛的病因和發病機制還沒有完全明了，但目前的研究表明，遺傳、血管壓迫、神經損傷、神經脫髓鞘等因素可能與三叉神經痛的發病有關。

1.遺傳

三叉神經痛可能與遺傳因素有關，部分患者有家族遺傳史。

2.血管壓迫

三叉神經根受到血管的壓迫，可能導致神經髓鞘的完整性受到破壞，從而引起異常放電，引發三叉神經痛。

3.神經損傷

頭面部的外傷、手術或感染等原因，可能導致三叉神經受損，引發炎癥或神經變性，進而引起三叉神經痛。

4.神經脫髓鞘

三叉神經感覺根或半月節內的神經脫髓鞘，可能是三叉神經痛的原因之一。脫髓鞘可能導致神經纖維的異位沖動發放，引起疼痛。

此外，病毒感染、自身免疫性疾病、精神緊張、壓力過大等也可能與三叉神經痛的發生有關。