多數患者初發感染癥狀，常在接觸皰疹病毒感染后2-12天，除了特征性的生殖器局部癥狀外，還可有發熱、頭痛、全身不適、淋巴結腫大等一系列全身癥狀。而復發與初發相比，一般時間短、病情輕。大多數情況下，多數患者的復發大約每年4次，但是也有少數患者會頻繁復發。皰疹復發之前，通常有局部刺癢、燒灼感或疼痛等先兆癥狀。值得注意的是，有高達60%的生殖器HSV感染者可不出現皰疹的體征，但卻仍然具有傳染性。皰疹的復發程度與個體差異有關，而疲勞、酗酒、免疫力低下、長期的精神緊張等因素有助于生殖器皰疹的頻繁復發。
復發性生殖器皰疹的治療應該以抗病毒治療為主。抗病毒藥物能阻止病毒在人體的復制、加速感染部位的愈合、縮短病程、減少復發次數。臨床上的抗病毒治療通常以口服藥為主。
局部感染的疼痛可以通過鹽水浴、冷水浴、大量飲水、口服阿司匹林、外用利多卡因乳膏等方法加以緩解。此外，還可以輔以胸腺肽、干擾素等藥物;多吃菇類食物(目前許多增強免疫力的藥物都是從菇類植物中提取的);勞逸結合;避免酗酒和精神焦慮緊張;內褲最好穿寬松棉質的。