腦癱的治療原則是早期發現和早期治療。嬰兒運動系統正處發育階段，早期治療容易取得較好療效。促進正常運動發育，抑制異常運動和姿勢。需要按照正常小兒發育規律進行功能訓練。
采取綜合治療手段。采取不同措施，除針對運動障礙外，應同時進行精神行為障礙干預，控制其癲癇發作，以阻止腦損傷的加重。注重小兒生活技能，社會適應能力訓練，以及一些特殊技能的康復訓練，以利未來的生活需要。做到醫師指導和家庭訓練相結合，以保證患兒得到持之以恒的正確治療。
功能訓練
體能運動訓練：物理療法(physical therapy，PT)，針對各種運動障礙和異常姿勢進行物理學手段治療，目前常用Vojta和Bobath方法，國內尚采用上田法。該方法可促進肌力及肌肉耐力和增加關節活動范圍，適合于稍大能夠合作的兒童。
小兒腦癱的治療
技能訓練：作業療法(occupational therapy，簡稱o'r)，重點訓練上肢和手的精細運動，提高患兒獨立生活技能。
語言訓練：包括聽力、發音、語言和咀嚼吞咽功能的協同矯正。
矯形器的應用
功能訓練中，配合使用一些支具或輔助器械，有幫助矯正異常姿勢、抑制異常反射的功效。
手術治療
手術治療主要用于痙攣型腦癱的治療，目的是矯正畸形、緩解肌肉痙攣、恢復或改善肌力與肌張力的平衡(包括肌腱延長術、骨關節手術，神經外科手術如“選擇性后根神經切斷術-SPR”等)。
藥物治療
痙攣型腦癱可選擇緩解肌張力的藥物，如巴氯酚、地西泮、A型肉毒毒素等。手足徐動型腦癱可試用苯海索等藥物治療。實踐證明，全身性口服藥物治療效果并不理想。
其他
如高壓氧治療、水療、電療等，對功能訓練起輔助作用。