(一)治療
最有效的治療是手術切除病變，良性或惡性腫瘤均可手術切除，約95%病例的病變可做完整切除。手術后4～6周肝組織可迅速修復，此時應復查CT及AFP和B超以作為日后復查的基礎。腫瘤相對的對放療不敏感，聯合應用順鉑與多柔比星(阿霉素)對肝母細胞瘤有效，可使不能切除的腫瘤轉變為能手術切除的病變，并可清除肺轉移灶。
廣泛的良性肝腫瘤不能行肝切除者，目前尚無有效療法。對侵及左、右肝葉的不能切除的血管瘤患兒，對引起心力衰竭的肝血管瘤如不能切除，可做肝動脈結扎。目前主張做肝動脈插管栓塞治療。
(二)預后
肝母細胞瘤經手術完整切除，存活率為85%，而肝細胞癌的存活率僅9%～35%。不完整切除腫瘤的患者常有局部復發而最終死亡。肝移植的結果也不樂觀。
其他原發性肝腫瘤常見的有：海綿狀血管瘤及血管內皮細胞瘤兩種,前者因腫瘤生長可壓迫肝組織使肝細胞變性，腫瘤內有動靜脈短路時，可致小兒心力衰竭或因腫瘤破裂出血死亡。血管內皮細胞瘤可因腫瘤生長慢而無臨床癥狀。
血管內皮細胞瘤屬于惡性，病程緩慢，但預后不佳。
廣泛的良性肝腫瘤不能行肝切除者，目前尚無有效療法。