中醫治療肌營養不良有較為成熟的經驗，遠期療效可達90%以上，無明顯副反應和較好的遠期療效，是中醫治療肌營養不良的兩大優勢。肌營養不良的飲食飲食宜高蛋白，富含維生素、鈣、鋅、瘦肉、雞蛋、魚、蝦仁、動物肝臟、排骨、木耳、蘑菇、豆腐、黃花菜等可適當多食，少吃或忌食過辣、過咸、生冷等不宜消化和有刺激性食品。
中醫治療應辯證與辯病相結合，中西醫結合治療是目前臨床治療重癥肌無力、肌營養不良癥、肌萎縮、運動神經元病等肌肉神經系統疾病的最佳途徑。
中醫認為肌營養不良屬“痿證”范疇，病機為正虛為本，脾腎肝虧、氣血不足。初病在脾，進而損及肝腎，每因六淫、勞倦、情志而誘發。中醫治療應辨別虛損臟腑，以扶正為主兼顧祛邪，佐以疏風散寒化濕、清熱、理氣化瘀通絡。
扶正以健脾益腎為要，貴在辯證精當，療程要長，緩緩圖功，以時間來換取療效。早期治療應以健脾益氣為主，中期重在補脾益腎，后期滋養肝腎，養陰益氣為要。眼肌型多治以健脾益氣升提，全身型貴在脾腎雙補，肌無力危象則應回陽救逆定喘。