很多浙江人都使用中藥香囊防治手足口病。香囊選用了藿香、艾葉、肉桂、山萘等上乘中藥配制的具有芳香化濁辟穢、清熱利濕解毒之功效。兒童只需每天佩戴在前胸(盡量離鼻口近點)，晚上睡覺時放置枕邊就行了。每半月換一包。浙江省中醫院副院長王笑鳴告訴記者，掛香囊只是預防手足口病的方法之一，尤其沒有手足口病接觸史的兒童。掛香囊是一種傳統的治療方法，在端午節，南方人就開始掛香囊，吃粽子，掛艾葉。其實這就是治未病的一種方法。浙江省中醫藥防治手足口病技術指導方案還列出了其他方法，比如用藿香、艾葉等中藥加入到敞開的容器里，每天加熱熏蒸房間30分鐘，或直接買1支艾條焚熏房間10至15分鐘;用白菊花、金銀花、生甘草等沸水沖泡再加點冰糖當茶喝，用薏米仁、扁豆、綠豆煮粥食用等。
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據介紹，在死亡的7例中，有幾例是因為家長拒絕醫生的住院要求，延誤了治療時間，才導致救治無效。
因為手足口病重癥患者從發病到死亡的平均時間為3.5~4天，若發生了重癥，住院治療能及時救治。為減輕困難家庭患者的顧慮，包括外來人口在內的所有杭州市內3歲以下手足口病患兒均可免費住院治療。