根據結石成分的不同，腎結石可分草酸鈣結石、磷酸鈣結石、尿酸結石、磷酸銨鎂結石、胱氨酸結石及嘌呤結石六類。大多數結石可混合兩種或兩種以上的成分，各種結石均有其各自的特點。
1.草酸鈣結石：占結石中80%~84%，常呈黃褐或石銅色，男性發病為多見，多有家庭史，在X線片上清晰可見。尿沉渣內常有草酸鈣結晶。
2.磷酸鈣結石：占結石中6%~9%，結石為白色，表面粗糙，常呈鹿角狀，質地較硬。常在堿性尿中形成。以青壯年男性為多見，多有家庭史，在X線片上清晰可見。
3.尿酸結石：占結石中6%~10%，表面光滑，常呈鹿角形，色黃或棕褐色，質地較硬，在X線片上模糊不清或不能出現。以男性多見，尤以痛風病人更常見，通常有家庭史。尿沉渣內可見尿酸結晶。
4.磷酸銨鎂結石：占結石中6%~9%，結石色黃或污灰色，呈樹枝狀或鹿角狀，質地較軟。以女性為多見，尿路感染的患者較多，不能透過X線。尿沉渣內可見磷酸銨鎂結晶。
5.胱氨酸結石：占結石中不到2%，結石色黃或白，表面光滑，呈圓形，不易透過X光線，常在酸性尿中形成。尿沉渣內可見胱氨酸結晶。
6.黃嘌呤結石：此類結石很少見到，色白或黃棕色，質地很脆，不能透過X光線，一般在酸性尿中形成。