同種免疫性反復自然流產的發生機理。在懷孕的過程中,胚胎可看作是具有父方50%遺傳物質的同種自然移植物，具有同種異體移植及自體移植的雙重特性。胎兒及其附屬物不被母體排斥并可在子宮內發育成熟，母體必須形成免疫耐受，否則將面臨流產的發生。
在正常妊娠期，母體的免疫功能發生變化,形成主要由特異性免疫抑制物(封閉抗體、抑制性T細胞)與非特異性因子(雌孕激素、人絨毛膜促性腺激素、人胎盤催乳素、促合成代謝因子、妊娠相關血漿蛋白等)共同組成的免疫維持系統。各種免疫學因素通過有機協調參與維持妊娠。
當母體免疫平衡失調的時候，對胚胎的排斥作用增強，這種排斥作用越強，發生流產的可能性就越大，治療的難度也就越大。