隨著現代醫學診斷技術的發展，總結出激素類藥物治療和營養性藥物治療不孕不育的方法，在臨床上也收到了較好療效。藥物治療不孕不育很適合非器質性損傷造成的不孕不育。
1.激素類藥物治療
選擇少精癥或精液質量差的病例為治療對象。
(1)絨毛膜促性腺激素(HCG)
目前臨床應用的制劑包含有促間質細胞激素(ICSH)和促卵泡激素(FSH)。它刺激睪丸曲細精管產生精子刺激間質細胞發育釋放睪丸酮，應用于垂體功能減退、FSH水平低下、繼發性睪丸生精功能障礙者。劑量為1000u，隔日肌肉注射1次，10～12周為一療程。
(2)氯菧酚胺
是一種合成的女性激素衍生物，在下丘腦競爭性地與雌二醇受體結合，抑制雌二醇對下丘腦的反饋作用，促使GnRH和垂體促性腺激素分泌而有利于精子發生，使用方法為每日～50mg口服25天停5天，持續3～6個月。
(3)睪丸酮
小劑量睪丸酮具有直接刺激生精上皮細胞，促進精子發生和提高精子活力的作用;大劑量睪丸酮反而抑制生精作用，不過一旦停藥則在半年左右出現反跳現象，導致促性腺激素升高和精子計數超過治療前水平，并持續數月之久。
具體用法為小劑量睪丸酮治療
甲基睪丸素10～15mg/d，或1-甲氫睪酮(mesterolone)50mg/天，或Flucrometerone50mg/d。大劑量睪丸酮治療可用丙酸睪丸酮50mg每周3次肌注，12周為一療程。或庚酸睪酮，每3周200mg，肌注，9周為一療程。
2.營養性藥物治療
療效不確切，下列藥物對病因不明的不育癥可能有益。
(1)足夠的蛋白質和維生素A、B和E。
(2)谷氨酸(glutamicacid)0.6～2g，口服，每天3次，2～3個月為一療程;或精氨酸(arginine)2～4g/d口服。
(3)補充某些微量元素，如給以鋅制劑可能有好處。