布加氏綜合癥主要為下腔靜脈阻塞癥狀和/或門靜脈高壓癥狀，但表現各不相同，包括有：下肢淺靜脈曲張、活動后足踝部腫脹、下肢腫脹色素沉著、慢性潰瘍、腹部不適或疼痛、上消化道出血、黑便或頑固性腹水黃疸。
布加氏綜合癥臨床表現取決于阻塞的部位、程度以及側支循環的狀況。輕度阻塞可無明確的癥狀或為原發病變的癥狀所掩蓋;一旦完全阻塞，癥狀和體征可很典 型。下腔靜脈下段的阻塞所引起的征狀，主要是下腔靜脈高壓狀態。下肢靜脈郁滯;兩下肢以至陰囊明顯腫脹，每于行走、運動后加劇，平臥休息后減輕。下肢淺靜 脈曲張，皮膚出現營養性改變，有時也可盤曲成團，似靜脈瘤樣改變。曲張靜脈一般位于胸腹前壁，也可位于胸腹側壁和后背，血流方向均向上。
如果病變累及腎靜脈或以上平面，則導致腎靜脈高壓、腎血流量減少、腎功能障礙。表現為腰痛，腎臟腫大，并可有蛋白尿、血尿。如進入慢性期，則因長期蛋白尿、全身浮腫、血膽固醇增高等，可形成所謂腎變性綜合征。
病變累及肝靜脈或以上平面，則可有下腔靜脈高壓、門靜脈高壓(包括肝脾腫大、腹水、食管靜脈曲張和上消化道出血等)和心貯備功能不足(包括動則心悸、氣促)三組臨床表現。急性肝靜脈阻塞可因急劇進行性腹水、肝昏迷而死亡。
下腔靜脈阻塞綜合征多數病人肝功能較好，白、球蛋白倒置或肝功能異常者約占1/3，可能由于此癥肝細胞病理改變為繼發性，且程度較輕之故。
倘若為腫瘤所致之下腔靜脈阻塞，則臨床上有腫瘤本身表現的腫塊和疼痛、臟器浸潤或轉移的肝腫大、黃疸、消化道功能障礙及咳血、胸痛等。