肛瘺非手術不能根治。其傳統手術常見的有瘺管切開術、肛瘺切除術和掛線療法，這些方法雖然可以有效治療肛瘺，但是手術過程非常疼痛，尤其是術后恢復時間超長，一般需要一個月左右的時間住院觀察調養，因此病友間往往用“人間煉獄”來形容肛瘺手術。
傳統手術治肛瘺創口大、恢復慢、術后傷口不平整
其實現在的醫療水平，已經可以做到微創治療肛瘺了。最新一代進口全電腦多功能肛腸治療系統操作，具有高頻電容場痔瘡治療功能、高頻電刀、電容場止血鉗功能，治療肛瘺具有痛苦小、出血少、快速、徹底，不需住院，不影響工作和學習的優點。
微創術的原理是通過直腸纖維鏡進入到肛門里面，通過監視器，仔細查找清楚肛瘺的內口，由于治療中出血極少，因此肛瘺的內口顯露非常清楚，以致于患者通過電腦的顯示器直接觀看到治療過程。
醫生通過微創電極頭，直接對內口進行微創電凝，使肛瘺的內口迅速干結閉合，然后通過纖維鏡直接清洗干凈瘺管及膿腫里面的膿液，這樣日后大便時，糞便里面的細菌和糞水進不到周圍的組織里面去，就不會形成感染、疼痛，不出現新的膿腫，那樣才會達到痊愈目的。