一、肛門濕疹的一般治療
避免接觸
過敏物質，按囑服藥，一般來說，治療用藥以抗過敏，止癢，有合并感染者需抗感染治療。對一些頑固性的手足濕疹可選擇光療法，有較好的療效。
二、肛門濕疹的藥物治療
常用西藥有脫敏藥、消炎止癢藥和鎮靜劑。如維生素C，每次0.1克，1日3次，樸爾敏，每次4毫克，1日3次。瘙癢厲害，影響睡眠時，可服用魯米那、安定等。為消炎止癢，可靜脈注射5%氯化鈣溶液，每次10毫升，或10%葡萄糖酸鈣溶液，每次10毫升，每日1次。
中醫藥和針灸治療濕疹有良好效果，急性肛門濕疹可選服龍膽瀉肝湯、四物消風飲，以清熱祛風、除濕止癢。慢性肛門濕疹可服用養血祛風、除濕止癢劑：
三、肛門濕疹的針灸治療
可選大椎、肺俞、曲池、三陰交、血海、長強等穴，有止癢消炎作用。
四、肛門濕疹的外用藥
急性期，可用5%硼酸溶液局部涂敷。或用蒼術15克，黃柏15克，地輸15克，大黃15克，苦參15克，煎湯，熏洗坐浴。慢性期，可用5%煤焦油軟膏、10%硫磺軟膏、膚輕松軟膏等外敷。或用中藥青黛散：青黛、黃柏各30克，石膏，滑石各60克，研為細粉，外敷。