1、外科拔甲是灰指甲的治療方法之一，在局部麻醉下，將患甲拔除。這種方法療效快，但創面大，易出血或引起感染。手術一般會感覺疼痛，效果有時也不盡人意。心臟病、高血壓、糖尿病等患者，不宜手術治療。
2、剝脫法也是灰指甲的治療方法之一，可與局部和系統療法聯合應用，分為化學法和外科法，前者主要應用尿素軟膏，也有人應用二氧化碳激光治療，燒灼剝脫甲板，在甲床愈合后，外用抗真菌劑。或者在甲板上打多個觸及角化過度組織的洞，再涂以外用藥。
3、浸泡法：這種灰指甲的治療方法是將藥物加在醋中，然后將病甲浸在醋液中，約30分鐘，病甲變軟后，再用小刀削治，每日或隔日浸泡治療1次，需持續3-6個月。
4、封包削法：將漢膚特康軟膏涂于患甲上封包起來，待軟化后削治。對已被真菌侵犯的變形、增厚的甲板予以削法，即去除增厚的、松脆的、凹凸不平的或有灰白色斑點的甲板，以得抗真菌藥物直接發揮作用。此法一般無出血，不易感染，也很少引起疾病，無副作用，在短期內可將殘存在甲床上的甲屑削治干凈，這也是一種灰指甲的治療方法。