淋巴結結核發病原因有兩種：一種是結核肝菌通過上呼吸道或隨食物在口腔及鼻咽部尤其是扁桃體腺引起的原發灶上感染。后沿淋巴管到達頸部淺深層淋巴結。各部位多為單側性淋巴結。受累咽部。重發病以上吸收后受累淋巴結核仍繼續發展形成冷膿腫或潰瘍。
另一種是原發結核感染后血中結核桿菌隨血行進入內側頸淋巴結，引起頸淋巴結核;還可以從腰腹部淋巴感染,然后汲及深部淋巴結群繼發感染，在頸淋巴結結核發病中較為常見。
結核病一般按部位及臟器命名。淋巴結核根據發病部位，主要有以下幾種：
1、頸部淋巴結核：
這是淋巴結核中最為常見的，女性多于男性。據日本資料統計，男性以30歲年齡組最多，女性以50歲年齡組最多。一般治療加強營養，增強體質。發病部位以右側為多見。西醫認為，本病多因結核桿菌經口腔(齲齒或扁桃體)侵入，由淋巴管到達頜下或頦下淋巴結;亦可因肺、腸結核病灶經血液擴散所致。中醫認為，本病為情志所傷，肝氣郁結，脾虛生痰。肝郁則化熱，痰熱互搏，敬于頸項之脈絡，而成瘰疬。亦因素體虛弱，肺腎陰虧，致使陰虧而火旺，痰火凝結而成瘰疬。
2、腋窩部淋巴結核：
本病臨床較少見。病人往往主訴腋窩部淋巴結腫大，疼痛就診;也有在胸部X線檢查時發現腋窩部或胸壁上部有鈣化灶。
3、腹股溝部淋巴結核：
腹股溝部淋巴結腫大，多來自下肢或外陰部的外傷。但是，結核菌向全身播散，偶爾也可發生。開始可為僅伴有輕度疼痛的腫脹，如不積極處理，則可自潰。
4、腹部淋巴結核：
一般由于全身播散或在腸結核的基礎上，相繼出現腹部淋巴結腫大。在主訴中，過去可能沒有任何消化系統癥狀，肺部也未發現病變是常有的。也有包括過去曾有腸結核癥狀，或者是因為治療肺結核，早已接受化療者。
5、肺門淋巴結核：
當機體尚未產生變態反應時，肺內初感染原發灶中結核菌借淋巴流侵入所屬淋巴結。從肺門到縱隔有許多淋巴結。病勢進展時，縱隔淋巴結也相繼發病，形成各種不同程度的干酪化，從肺淋巴結流借肺門縱隔淋巴結，最后多從右靜脈角淋巴流入肺靜脈內，故結核菌隨其易于流入血流。因此，肺門淋巴結核是處于容易發生潛在性菌血癥的狀態。