單純肥胖癥是由遺傳和環境因素共同作用而產生的，遺傳因素所起的作用很小，環境因素起著重要作用，環境因素中家庭生活方式(家庭聚集性)和個人行為模式是主要的危險因素。
小兒肥胖癥的病因
1.遺傳與環境因素
肥胖者有一定的家族傾向，肥胖小兒的父母往往顯示肥胖癥狀，大約有1/3左右的人與父母肥胖有關，如果父母兩人都超過正常體重，子代中2/3出現肥胖，此外，有遺傳傾向的疾病亦常見肥胖癥狀，如肝糖原累積癥等。
2.多食
小兒自幼養成多食，能量攝入過多，消耗減少，特別是習慣于攝取油膩食物，日久即可發生肥胖現象。
(1)不合理喂養：如過早添加固體食物(生后1～2個月)和斷奶過早，是嬰幼兒期促成單純肥胖癥產生的一種喂養模式，近年來，兒童肥胖發生率的增高趨勢與父母給予的不合理飲食及營養攝入過多有很大關系，主食量，肉食量高，水果，蔬菜量低。
(2)食欲亢進：食欲亢進，進食過快是肥胖兒童的一個攝食特征。
3.少動
小兒缺乏適宜的體育鍛煉，加上多食的因素，活動減少及攝入與排出的不平衡，更容易形成肥胖，肥胖的小兒往往不喜歡活動，愈不活動則愈胖，形成惡性循環。
4.脂肪細胞數目的增多與肥大
在脂肪組織細胞的增殖和細胞擴大的關鍵時期(孕后期，產后早期和青春期)不良的生活方式，行為特征作為危險因素促成了單純肥胖癥的形成。
5.溺愛
家長的動機因素對肥胖兒童超量喂養起著重要作用，溺愛是一個不可忽視的因素，我國傳統的重男輕女的社會習俗和某些傳統的文化觀念(過度約束兒童活動等)是造成男童中重度肥胖檢出率高的一個不可低估的動機因素，低收入家庭是今后一段時間內持續產生肥胖兒童的一個重要來源。
溫馨提示：孕期頭3個月細胞水平營養不良，孕期后3個月營養過量，孕期體重增重過大，過速，是子代生后肥胖的孕期危險因素，脂肪細胞數目的逐漸增多與年齡增長及脂肪堆積程度有關，從小兒時期開始肥胖的人，成年后仍肥胖則體內脂肪細胞的數目明顯增多,而緩慢持續的肥胖，則既有脂肪細胞的肥大又有脂肪細胞的增多，一個肥胖人的全身脂肪細胞可比正常人的脂肪細胞增加3倍以上。