1、微生物感染(10%)
各種病原微生物的感染，如病毒、細菌、寄生蟲、原蟲等，其中以肝炎病毒最為重要。藥物和毒物的損害，由于人類接觸化學(xué)物質(zhì)和藥物的機會越來越多，故藥物性和中毒性疾病也相應(yīng)增加。
2、代謝異常(5%)
代謝異常，由于肝臟是物質(zhì)代謝的中心，任何一種物質(zhì)代謝都與肝臟密切相關(guān)，如膽色素代謝異常可致黃疸、脂肪代謝異常可致脂肪肝、銅代謝異常引起豆狀核變性等。
3、環(huán)境因素(70%)
目前認為肝臟疾病中約70%是由病毒、化學(xué)物質(zhì)、酒精(或營養(yǎng)不良)三大環(huán)境因素所致。
4、遺傳(15%)
約15%是與代謝或其他先天異常的遺傳因素有關(guān)。
5、病理改變：歸納為六個方面
①肝細胞變性壞死導(dǎo)致細胞形態(tài)和功能的異常。
②膽汁淤滯，既可由肝細胞破壞分泌膽汁的功能障礙，也可由膽道梗阻所致，病理上主要表現(xiàn)為肝細胞內(nèi)和膽管系統(tǒng)內(nèi)膽色素沉著和膽栓形成。
③肝實質(zhì)內(nèi)炎性反應(yīng)，表現(xiàn)為匯管區(qū)為主的炎細胞浸潤、庫普弗氏細胞增生以及肉芽腫形成等。
④間質(zhì)纖維組織增生，尤其是慢性肝炎時，以匯管區(qū)為中心肝間質(zhì)纖維組織增生，可互相延伸、連接。原有肝小葉破壞、分隔、改建，逐步發(fā)展為肝硬變，導(dǎo)致臨床上出現(xiàn)門脈高壓癥。
⑤肝占位性病變，主要見于肝腫瘤和肝膿腫，病變占據(jù)肝實質(zhì)的一部分，并壓迫周圍的正常組織。
⑥肝血管系統(tǒng)損害，如肝硬變造成肝血流量減少和門靜脈高壓癥。此外尚有肝靜脈阻塞(巴德-基亞里二氏綜合征)和肝動脈梗塞等。