病因和病理機制尚不明確，可能和以下原因有關。
1、遺傳因素
口吃患者家族發病率可達36%～55%，故有人認為與遺傳因素有關，可能為單基因遺傳。有人發現的孩子口吃是有家族遺傳史，主要外因是學習語言的環境不佳，如父母口吃，或父母口語快、含混，兒童不易模仿等。也有人發現口吃患者及親屬中左利手多見，認為口吃與大腦優勢側有關。
2、精神因素
兒童口吃往往發生在急性或遷延性精神創傷之后，因而不少學說認為精神因素可能為口吃的重要發病原因。有的兒童因為受到家長、老師或周圍一些人的嚴厲懲罰或訓斥，使精神突然受到嚴重打擊，由于這種恐懼的情緒或驚嚇引起了口吃.。精神緊張、焦慮等也會導致口吃現象。
3、軀體因素
先天的發育不良也引起口吃。較多兒童圍產期或嬰幼兒期曾受到有害因素作用，如胎兒期母體患妊娠毒血癥、出血或軀體性疾病，或發育過程中患某些傳染病使神經系統功能弱化，言語功能受累而致口吃。
4、外界因素
強行糾正左撇子也會造成口吃。
5、方言性口吃
兒童學語期間改變方言，或兼學兩種以上不同方言，可致口吃。
6、思維過速性口吃
因思路寬闊迅速，致使口齒追隨不及，造成口吃。臨床亦較常見。
7、其它因素
有的學齡前兒童罹患口吃是因模仿所致。有資料則根據腦電圖、發音肌肌電圖和氟哌啶醇臨床療效。推斷口吃可能與邊緣系統和網狀結構復合體活動增強、發音肌功能不協調、和基底節存在生化障礙等因素有關，但尚待臨床進一步論證。