一、引發多種炎癥
生殖感染局部癥狀雖然可以在一定的時間、范圍內減輕或消失，但并不代表病癥已經痊愈，很可能是病癥由急性轉為慢性，病變向更深層次擴展，引起睪丸炎、附睪炎、精囊炎、尿道炎等。
二、影響性生活
男性尿路感染對性生活的影響也非常大。尿路感染可不同程度的影響泌尿道、性腺、附屬性腺以及外生殖器的正常功能，導致性欲低下或性功能障礙。
三、引發家庭感染
生殖感染危害的對象不僅是自己，還包括性伴侶、子女在內的家庭成員。當夫妻一方患病，另一方被傳染患病的可能高達70%左右，而接觸患者使用的被褥、毛巾、浴盆、坐便器的家人間接導致感染的幾率也在40%。夫妻一方得病，雙方都要檢查治療。
四、導致男性不育
據醫院臨床統計，已婚夫婦中不育者約占15%，而這其中近50%的原因來自男方。其主要原因是，生殖感染可影響男性精子生成、精子活力及精子運輸能力，造成少精、弱精、死精、精子畸形，直接導致男子生育能力下降。