肥厚型梗阻性心肌病由于病因不明，預防較困難。超聲心動圖檢出隱性病例后進行遺傳資料可作研究。為預防發病應避免勞累、激動、突然用力。凡增強心肌收縮力的藥物如洋地黃類、β受體興奮藥如異丙腎上腺素等，以及減輕心臟負荷的藥物如硝酸甘油等使左心室流出道梗阻加重，盡量不用。如有二尖瓣關閉不全，應預防發生感染性心內膜炎。
肥厚型梗阻性心肌病預防方法：
1. 減肥：
肥胖者患心臟病的比例遠遠高于正常體重的人，特別是“蘋果形”身材(腰臀肥胖)的人更危險。只要老人減肥3--5公斤，心臟狀況就會有很大改善。同時，專家告誡較胖的老人，不要指望自己一下子變成超級模特，要通過平衡飲食和鍛煉逐漸達到減肥的目的。
2. 少吃蛋黃：
一個普通大小的蛋黃約含膽固醇200毫克。老人膽固醇較高的話，一周最多只能吃兩個蛋黃。
3. 多運動：
每天適度運動20分鐘，可使患心臟病的幾率減少30%，快走的效果最好。
4. 戒煙：
吸煙者患心臟病的比例是不吸煙者的2倍。研究發現，戒煙2--3年后，患心臟病的風險就會降至與不吸煙者一樣的水平。
5. 注意飲食：
平時生活中堅持吃低脂肪食品，如瘦肉和低脂乳制品等。
6. 適量飲酒：
1周喝3--9杯酒為適量，對心臟有好處。但要注意別貪杯，因為飲酒過度會引發心臟病。
7. 當心糖尿病：
有糖尿病的人患心臟病的比例是其他人的4倍。因此，老人要定期體檢，對糖尿病“早發現，早治療”。
8. 控制情緒：
脾氣暴躁，遇到突發事件不能控制自己，也容易誘發心臟病。
肥厚型梗阻性心肌病病程發展緩慢，預后不定。可以穩定多年不變，但一旦出現癥狀則可以逐步惡化。猝死與心力衰竭為主要的死亡原因。猝死多見于兒童及年輕人，其出現和體力活動有關，與有無癥狀或有否梗阻有關，心室壁肌厚程度高，有猝死家族史，有持續性室性心動過速者為猝死的危險因子，猝死的可能機制包括快速室性心律失常，竇房結病變與心傳導障礙，心肌缺血，舒張功能障礙，低血壓，以前二者最重要。心房顫動的發生可以促進心力衰竭。少數患者有感染性心內膜炎或栓塞等并發癥。