肝內(nèi)膽管結(jié)石一般稱為肝膽管結(jié)石，它的原因特別的多，主要由于膽道感染，膽汁淤積，經(jīng)常飲食一些高膽固醇的食物導(dǎo)致膽固醇結(jié)晶，有時膽道解剖變異，營養(yǎng)不良都會引起肝內(nèi)膽管結(jié)石。

結(jié)石主要是棕色的膽色素結(jié)石，一般在肝段，肝葉分布，肝內(nèi)膽管結(jié)石形成主要與飲食有關(guān)，尤其是飲食一些高脂類，高油膩的食物，經(jīng)常飲食一些動物內(nèi)臟，它們含有豐富的膽固醇，膽汁排出不暢，容易形成結(jié)石。

有時肝內(nèi)膽管炎也會引起膽管內(nèi)反復(fù)感染，加重炎癥從而引起狹窄，有時也會促使肝內(nèi)膽管結(jié)石的形成。