膽結石手術包括傳統的開腹手術、腹腔鏡微創手術和內鏡逆行胰膽管造影（ERCP）介導下內鏡取石術等。根據膽結石的大小、位置、數量等各不相同，具體的手術又分為很多種方式，常見如下。

膽囊內結石目前主要的手術方式是腹腔鏡下膽囊切除術。如果膽囊內結石較多，術中需要進行膽道探查術。

膽管結石分為肝內膽管結石、肝外膽管結石和膽總管結石。膽總管結石可以通過膽道切開取石手術治療。肝內膽管結石如果數量較少、位置較表淺，可以做肝臟切開取石術。如果數量較多但較集中、位置較深，可以做肝葉切除術。