排卵期小腹疼痛、腰疼，可能是生理因素所致，還考慮是盆腔炎、宮頸炎等病理因素造成的，具體如下：

1、生理因素：排卵期女性體內激素水平發生變化，卵泡破裂，卵泡液刺激腹膜、盆腔，從而會出現小腹疼痛、腰痛等癥狀。

2、盆腔炎：沙眼衣原體、淋病奈瑟菌、陰道加德納菌、溶血性鏈球菌等病原體感染可引起盆腔炎。患者盆腔部位受到炎癥因子的刺激，從而會導致小腹疼痛腰疼。

3、宮頸炎：此病與病原體感染、宮頸細胞損傷等因素有關。患者除了會出現腰腹部疼痛的癥狀，還可伴有分泌物增多、月經間期出血、性交疼痛等癥狀。