腦衰弱綜合征與神經衰弱可以通過體格檢查、CT檢查、核磁共振成像等方式來鑒別，具體如下：

1、體格檢查

雖然腦衰弱綜合征與神經衰弱二者都可出現頭暈的癥狀，但腦衰弱綜合征常以眩暈為主，而神經衰弱患者眩暈的癥狀較為少見。

2、CT檢查

腦衰弱綜合征與神經衰弱都可由心理因素引起，但腦衰弱綜合征也可由腦外傷、腦腫瘤、腦梗死等因素引起，患者可以通過頭顱CT的方式，檢查腦內有無器質病變，來幫助鑒別這兩種疾病。

3、核磁共振成像

腦動脈硬化癥、腦缺氧等因素也有可能會引發腦衰弱綜合征；而神經衰弱一般是由精神因素引起，患者可以通過核磁共振成像來檢查血管的狀態，幫助分辨這兩種疾病。