初期肛周膿腫一般不會自愈。

肛周膿腫一旦存在化膿現象，就說明患者病情已經較為嚴重，一般并不能達到自愈目的。處于初期肛周膿腫患者，應及時就醫，通過藥物治療、手術治療等方法，減輕患者痛苦、減少膿腫損傷，同時降低肛周膿腫的復發率，多數患者可以達到良好的治愈目的；但對于初期肛周膿腫想要通過自身免疫力達到自愈目的的患者，則可能會由于膿腫逐漸加重，出現劇烈疼痛感，如果不及時處理，很可能會形成肛瘺，甚至是引發膿毒血癥，產生嚴重危害。

出現肛周膿腫的患者應當及時進行就醫治療，以免病情加重。