膝關節滑膜皺襞綜合征的病因較為復雜，常見的有先天性因素、膝關節損傷、膝關節退變等。

1.先天性因素

滑膜皺襞在胎兒發育過程中若出現異常，可能會引起其增厚、肥大，進而引發膝關節滑膜皺襞綜合征。

2.膝關節損傷

膝關節的創傷、炎癥等病變，可能會刺激滑膜皺襞，使其增生、肥厚，甚至出現炎癥反應，從而引起膝關節滑膜皺襞綜合征。

3.膝關節退變

隨著年齡的增長，膝關節會發生退變，滑膜皺襞也會逐步老化、纖維化，彈性降低。這種情況下，滑膜皺襞在活動時容易受到磨損、刺激，引發炎癥，導致膝關節滑膜皺襞綜合征。