多囊卵巢綜合征的病因尚不清楚，一般情況下和遺傳、下丘腦-垂體-卵巢軸功能紊亂、胰島素抵抗、腎上腺內分泌功能異常、高泌乳素血癥等有關。

1.遺傳因素

部分多囊卵巢綜合征患者存在家族聚集現象，提示遺傳因素可能起一定作用。

2.下丘腦-垂體-卵巢軸功能紊亂

該軸的調控機制異常，導致卵巢分泌的雄激素過多，進而出現高雄激素血癥。

3.胰島素抵抗

胰島素抵抗導致胰島素水平升高，進而刺激卵巢分泌雄激素，形成高雄激素血癥和胰島素抵抗的惡性循環。

4.腎上腺內分泌功能異常

部分多囊卵巢綜合征患者存在腎上腺皮質功能亢進，分泌過量的雄激素。

5.高泌乳素血癥

泌乳素水平升高也可能與多囊卵巢綜合征的發生有關。