嚴重急性附睪炎不可逆的終末期即為慢性附睪炎，此時可經常出現較急性附睪炎癥狀輕的表現。慢性附睪炎由于纖維增生使整個附睪硬化，顯微鏡下疤痕非常顯著，常可看到附睪管閉塞，組織被淋巴細胞和漿細胞浸潤。
(一)癥狀慢性附睪炎通常無癥狀，除非有急性發作的情況，此時可出現局部不適，病人可觸及陰囊內有一腫塊，附睪增厚并增大，有或無壓痛，觸診極易將附睪與睪丸區分開，精索往往增粗，有時輸精管直徑增大，前列腺變硬并有纖維化，前列腺液常可見膿細胞，尿液分析可顯示繼發于前列腺炎的感染。
結核性附睪炎與慢性附睪炎很相似，輸精管呈串珠狀，同時精囊增厚，尿液檢查為“無菌尿”，或“結核菌尿”，由此可提示為結核性附睪炎，膀胱鏡可見膀胱潰瘍，尿路X線檢查也可幫助診斷。
睪丸腫瘤可有睪丸包塊，觸診可發現增厚變硬的附睪，感覺減退的睪丸(腫瘤)。附睪腫瘤少見，與附睪炎鑒別需依靠病理。如果慢性附睪炎為雙側，可導致不育。
(二)治療單用抗生素往往治療效果不滿意，前列腺炎必須控制，如附睪炎反復發作引起前列腺炎應在非發作期行輸精管結扎術，前列腺炎可治愈，有時也可行附睪切除術。
(三)預后除了疼痛及雙側附睪炎可能致不育外，慢性附睪炎無嚴重后果，一旦達纖維化期，則無法使其逆轉。
